Блокада Ленинграда – особая, трагическая страница в жизни города. Сотрудники и работники Русского сада, Летнего и Михайловского садов в этот период участвовали в сохранении всемирно известных памятников истории и культуры. В первые военные месяцы на Урал была эвакуирована часть экспонатов, на протяжении всей осады города усилиями сотрудников сохранялись музейные коллекции.